小智与皮卡丘在古老城池邂逅幻之宝可梦比克提尼，卷入真实与理想传说的对决。
小智一行人来到拥有千年历史的“大地之剑”城池艾因提欧，邂逅了能赋予人或宝可梦无限能量的幻之宝可梦比克提尼。比克提尼数百年来被城堡的结界所困。与此同时，青年训练家德雷多为了复兴他心目中理想的故乡（一个因资源枯竭而衰败的城镇），企图利用比克提尼的力量移动整个艾因提欧城。他的执念引来了传说中代表“理想”的黑之英雄——捷克罗姆。而坚信与宝可梦共存才是“真实”的小智，则得到了另一只传说宝可梦的认可。一场关于“理想”与“真实”的碰撞就此展开，小智必须帮助比克提尼获得自由，并找到让所有人（包括宝可梦）都幸福的道路。
影片格局宏大，对“理想”与“真实”的探讨赋予了故事深度。比克提尼可爱又令人同情，它与小智的友谊是最大泪点。捷克罗姆的登场气势磅礴，双传说对决的场面震撼，是系列剧场版中的经典之作。